MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 megaplasmid

Total Repeats: 6083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007974	GTAT	2	8	16	23	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007974	GC	3	6	30	35	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007974	ACGCA	2	10	49	58	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_007974	TAA	2	6	104	109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007974	CGC	2	6	274	279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_007974	ACA	2	6	429	434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007974	CTG	2	6	515	520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007974	AGT	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007974	GTATCG	2	12	728	739	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_007974	ATACGT	2	12	868	879	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007974	A	6	6	2061	2066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007974	T	6	6	2086	2091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007974	TGG	3	9	2128	2136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007974	AAC	2	6	2385	2390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007974	CGA	2	6	2432	2437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007974	CAT	2	6	2469	2474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007974	AAG	3	9	2552	2560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007974	TC	3	6	2608	2613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007974	CAT	2	6	2731	2736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007974	ACA	2	6	6192	6197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007974	ATT	2	6	6255	6260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007974	T	6	6	6259	6264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007974	C	6	6	6375	6380	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_007974	GAC	2	6	6404	6409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007974	CGG	2	6	6414	6419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007974	CAGGG	2	10	6421	6430	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_007974	AC	3	6	6433	6438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007974	CTG	2	6	6469	6474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007974	CCG	2	6	6506	6511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_007974	CAT	2	6	6532	6537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007974	ATG	2	6	6558	6563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007974	TC	3	6	6566	6571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007974	CTT	2	6	6626	6631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007974	CGCA	2	8	6639	6646	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007974	TGA	2	6	6650	6655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007974	CGT	2	6	6676	6681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007974	ATT	2	6	6760	6765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007974	CCA	2	6	6840	6845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_007974	CGTGC	2	10	6859	6868	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_007974	GAA	2	6	6933	6938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007974	GCG	2	6	6974	6979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007974	CGA	2	6	7150	7155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007974	GCC	2	6	7193	7198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_007974	CACGC	2	10	7237	7246	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_007974	CGG	2	6	10014	10019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007974	CCA	2	6	10027	10032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_007974	GC	3	6	10047	10052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007974	GGT	2	6	10969	10974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007974	TGAG	2	8	10975	10982	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007974	CTT	2	6	14101	14106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007974	T	7	7	14105	14111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007974	GAG	2	6	14117	14122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007974	GCG	2	6	15750	15755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007974	TGA	2	6	15770	15775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007974	GGA	2	6	15819	15824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007974	C	6	6	15832	15837	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_007974	GTTC	2	8	15847	15854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007974	CCT	2	6	15891	15896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_007974	GTC	2	6	16043	16048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007974	CGG	3	9	16067	16075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007974	CCA	2	6	16100	16105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_007974	GAA	2	6	16112	16117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007974	GGCAT	2	10	16817	16826	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_007974	TGC	2	6	16897	16902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007974	CGT	2	6	16952	16957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007974	CGC	2	6	16967	16972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_007974	ATT	2	6	17995	18000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007974	CTT	2	6	18005	18010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007974	TCC	2	6	19453	19458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_007974	AGGG	2	8	19460	19467	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007974	CGG	3	9	19477	19485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007974	GCT	2	6	19499	19504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007974	AGG	2	6	19513	19518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007974	GCG	2	6	19600	19605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007974	AAG	3	9	19610	19618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007974	GC	4	8	20478	20485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_007974	GGC	2	6	20541	20546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007974	GGT	2	6	20551	20556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007974	ACC	2	6	20580	20585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_007974	AGGC	2	8	21207	21214	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_007974	GC	3	6	21213	21218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007974	GGCC	2	8	21271	21278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007974	GAA	2	6	21287	21292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007974	TCG	2	6	21619	21624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007974	A	6	6	21629	21634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007974	CCG	2	6	21640	21645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_007974	TTAC	2	8	21698	21705	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_007974	CG	3	6	21719	21724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007974	AGA	2	6	21742	21747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007974	CG	4	8	21758	21765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_007974	GGAT	2	8	21855	21862	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007974	CAA	2	6	24136	24141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007974	CGC	3	9	24166	24174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_007974	GC	3	6	24173	24178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007974	ATGGA	2	10	24222	24231	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007974	AGG	2	6	25710	25715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007974	CCT	2	6	30244	30249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_007974	GCG	2	6	30289	30294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007974	CG	3	6	30320	30325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007974	TCC	2	6	30364	30369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_007974	CAA	2	6	30453	30458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007974	CGG	2	6	30482	30487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007974	GGC	2	6	30499	30504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007974	GCG	2	6	30547	30552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007974	AGG	2	6	30622	30627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007974	GGGATG	2	12	31376	31387	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007974	GCC	2	6	31402	31407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_007974	TGT	2	6	32525	32530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007974	CCG	2	6	32538	32543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_007974	CG	5	10	32583	32592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007974	CCG	2	6	32646	32651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_007974	GGC	2	6	32703	32708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007974	TCCG	2	8	32710	32717	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007974	ATG	2	6	32770	32775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007974	AGCC	2	8	34402	34409	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007974	CGG	2	6	36784	36789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007974	GGA	2	6	36871	36876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007974	CG	3	6	38730	38735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_007974	GGCA	2	8	38737	38744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_007974	GCC	2	6	40400	40405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_007974	GC	3	6	41301	41306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_007974	CGAC	2	8	41324	41331	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007974	AGG	2	6	41415	41420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007974	GTC	2	6	41429	41434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007974	CAG	2	6	42638	42643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007974	GAA	2	6	42680	42685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007974	CCTG	2	8	46582	46589	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007974	CAC	2	6	46717	46722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_007974	GCG	2	6	46774	46779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007974	CAC	2	6	46815	46820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_007974	AGG	2	6	46868	46873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007974	CAG	2	6	50717	50722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007974	TCA	2	6	50786	50791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007974	CGTA	2	8	50806	50813	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_007974	GGC	2	6	52201	52206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007974	GAGGG	2	10	53895	53904	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007974	TTCG	2	8	55444	55451	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_007974	G	7	7	57684	57690	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007974	CA	3	6	57717	57722	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_007974	TGCTT	2	10	58793	58802	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_007974	TGC	2	6	58814	58819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_007974	GACA	2	8	58825	58832	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_007974	GCC	2	6	58833	58838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_007974	CG	3	6	58917	58922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_007974	GAAA	2	8	58951	58958	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007974	ATTC	2	8	59076	59083	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_007974	TGG	2	6	59087	59092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_007974	ATT	2	6	59215	59220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_007974	AT	3	6	117248	117253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_007974	ACTG	2	8	117277	117284	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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429	NC_007974	AGG	2	6	152350	152355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_007974	TAA	2	6	152393	152398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_007974	ATG	2	6	152469	152474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_007974	CGG	2	6	152507	152512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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471	NC_007974	TCC	2	6	163963	163968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
472	NC_007974	CAT	2	6	164845	164850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
473	NC_007974	GTG	2	6	165161	165166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
474	NC_007974	TTGC	2	8	165179	165186	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
475	NC_007974	GAA	2	6	165260	165265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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486	NC_007974	TGG	2	6	174927	174932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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